Prima etapă a diagnosticului microbiologic al bolilor infecțioase este alegerea materialului pentru studiu, datorită patogenezei bolii. Distingem următoarele metode de diagnostic microbiologic al infecțiilor bacteriene: bacterioscopice, bacteriologice, biologice, serologice, alergice. Metodele bacteriologice, bacteriologice și biologice sunt destinate detectării
agent patogen în materialul de testare. Metoda bacterioscopice este de a pregăti un frotiu a materialului investigat, culoarea sa (uneori studiat agent patogen într-o stare de viață) și microscopie. Această metodă găsește o aplicare limitată, deoarece poate fi utilizată numai în prezența oricăror caracteristici morfologice sau tinctinare ale agentului patogen și a conținutului suficient de agent patogen în materialul investigat.
natura toxinei. Cu toate acestea, formularea diagnosticului bolilor microbiene infecțioase se poate face numai prin izolarea și identificarea agentului patogen, dar, de asemenea, la detectarea anticorpilor specifici acestora. Pentru a face acest lucru, utilizați metoda serologică, constând în
formularea reacțiilor de imunitate. Anticorpii la agentul cauzal al bolii apar, de regulă, până la sfârșitul prima săptămână de boală, din acel moment, și de a folosi aceste metode. În unele cazuri, metoda serologică poate viza identificarea unui antigen specific direct în materialul studiat. În special, pentru diagnosticarea rapidă a bolilor infecțioase sunt utilizate reacție imunofluorescența, permițând rapidă (în câteva ore) pentru a identifica agentul patogen în materialul. In final, metoda alergică are ca scop identificarea hipersensibilitatea la alergeni specifici, care este agentul cauzal al bolii. Un exemplu al acestei metode este formularea testelor alergice cutanate. Metoda se bazează pe fenomenul de hipersensibilitate de tip întârziat. Metodele genetice moleculare de diagnosticare sunt de asemenea utilizate: PCR, hibridizarea ADN etc.