Bormann a fost extrem de negativ în ceea ce privește creștinismul și, prin urmare, în 1936 a părăsit oficial biserica. În 1937 a interzis adoptarea "persoanelor de rang spiritual" în NSDAP. În 1938, a emis o circulară, care a declarat că "viziunea asupra lumii socialiștilor naționali este adevărata credință". Unul dintre cei care au inspirat programul eutanasiei, a cărui implementare a fost încredințată Oficiului Personal al Führerului, condus de Philip Bowler. După zborul lui Rudolf Hess din 10 mai 1941, Marea Britanie a devenit absolut necesară pentru Hitler. dar nu a primit toate posturile șefului său. La 12 mai 1941, a condus Cancelaria Partidului (creat din Statul Major al Führer) în gradul de înalt funcționar, iar pe 13 mai a devenit secretar al Führer-ului. Din 29 mai - un ministru imperial fără portofoliu și membru al Consiliului de Apărare al Reich-ului.
- Organizarea dosarelor personale ale Fuehrer;
- Participarea la toate negocierile Führer-ului;
- Rapoarte privind evenimentele curente către Führer;
- Transmiterea deciziilor și a opiniilor Führerului către miniștrii imperiali;
- Soluționarea litigiilor și determinarea competenței anumitor ministere și departamente;
- Reorganizarea orașului Linz;
- Monitorizarea locuințelor lui Hitler;
- Gestionarea unui grup de stenografi în discutarea legii marțiale.
Corpul lui Bormann nu a fost descoperit inițial, iar moartea lui nu a fost confirmată. De aceea, el a fost mult timp considerat a fi ascuns, iar în 1945 a fost extrădat în absență ca principalul criminal de război la tribunalul Tribunalului Militar Internațional de la Nürnberg.
Cu toate acestea, aceste declarații nu au fost recunoscute ca o dovadă suficientă a morții lui Bormann. În 1946, Tribunalul Militar Internațional de la Nürnberg a încercat Bormann în absență și la condamnat la moarte. Avocații au insistat asupra faptului că clientul lor nu a fost supus instanței deoarece era deja mort. Instanța nu a considerat argumentele convingătoare, a revizuit cazul și a adoptat un verdict. stipulând în același timp că Bormann, în caz de detenție, are dreptul să depună la timp o cerere de clemență.
De câteva decenii au fost exprimate câteva versiuni ale viitorului lui Bormann:
- sa sinucis - versiunea oficiala;
- a fost înscris în inteligența britanică, până în 1956 a locuit în Anglia. apoi a fost trimis în Paraguay. unde a murit în 1959 (alte surse susțin că a trăit în Anglia până în 1989);
- a fost recrutat de serviciile sovietice;
- a fost recrutat de serviciile americane de informații și a lucrat pentru CIA.