Cap 5 „(sau cap) (de la cap English -. Cap) - o nucleotidă modificată guanidină, care se adaugă la 5“ (față) capătul ARNm imatur. Această modificare este foarte importantă pentru recunoașterea ARNm de inițiere a translației, precum și pentru protecția împotriva 5'nukleaz - enzime care degradează lanț de acizi nucleici cu neprotejată capătului 5“.
Regiunea de codificare constă din codoni - urmând direct secvențe succesive de trei nucleotide, fiecare dintre care corespunde codului genetic un anumit aminoacid sau începutul și sfârșitul sintezei proteinelor. Regiunile de codificare începe cu codonul start și se termină cu unul dintre cele trei codoni stop. Citind secvența de codoni și asamblare pe baza secvenței de aminoacizi a moleculei de proteină este sintetizată de ribozomi, cu participarea ARN-ului de transfer în procesul de traducere. În plus față de proteinele codificate, părți ale regiunilor de codificare pot servi ca secvențe de evacuare. De exemplu, ARN structura secundară, în unele cazuri, determină rezultatul traducerii.
Monocistronici și ARNm policistronic
monocistronici ARNm este numit, în cazul în care conține informațiile necesare pentru difuzarea numai o proteină (un cistron). Policistronici ARNm codifică mai multe proteine. Genele (cistronii) astfel ARNm intergennymi separat, secvențe non-codare. Policistronici caracteristic ARNm al procariote și virusurilor, eucariotele majoritatea ARNm este monocistronici [4]. Policistronici ARNm se găsește în mitocondriile eucariotelor.
netraduse - porțiuni de ARN situate înainte de codonul start și după codonul stop, care nu codifică o proteină. Acestea sunt numite regiunea netranslatată 5“și regiunea 3'-netranslată, respectiv. Aceste regiuni sunt transcrise ca parte a aceluiași transcrierii ca și regiunea de codificare. netraduse au mai multe funcții în ciclul de viață al ARNm-ului, inclusiv reglarea stabilității ARNm, localizarea ARNm și eficiența translației. stabilitatea ARNm poate fi controlată de către 5'- și / sau regiunea 3 'a sensibilității variind enzimelor care sunt responsabile pentru degradarea ARN - proteine de reglementare și RNazele care accelerează sau încetinește degradarea [5].
secvență lungă (adesea câteva sute de nucleotide) din adenina baze, care este prezent la "coada" 3 ARNm eucariot este sintetizat de către enzima poliadenilat polimerază. In eucariotele superioare poli-A coadă adăugat la ARN transcris, care cuprinde o secvență specifică, AAUAAA. Importanța acestei secvențe poate fi văzută în mutații în globinei umane 2, care se schimbă la AAUAAA AAUAAG, rezultând într-o cantitate insuficientă în corpul globină [6].
structura secundară
Aspectul ARNt structura secundară după prelucrare
„Stem-loop“ - un element al structurii secundare a ARNm schematic
„Pseudoknot“ - element de ARNm structură secundară, schematic
De asemenea, structura primară (secvența nucleotidică) are o structură ARNm secundară. Spre deosebire de structura secundara ADN, care se bazează pe interacțiunile intermoleculare (dublu helix ADN format din două molecule liniare, unite între ele pe întreaga lungime a legăturilor de hidrogen), structura ARNm secundară pe baza interacțiunilor intermoleculare (molecule liniare „falduri“, și apar legături de hidrogen între diferitele părți ale aceleiași molecule).
Exemple de structuri secundare pot servi ca stem-buclă și pseudoknot [7]
Structuri secundare din ARNm utilizat pentru reglarea translației. De exemplu, inserția de aminoacizi neconvenționali în proteine, pirolizină selenometionină si depinde de stem bucle situate în regiunea netranslatată 3“. Pseudoknots sunt programate pentru a modifica cadrul de citire a genei.
ARNm-ul viral structuri secundare complexe (inițiere traducere „).
2. Structura ARNm (19 problemă). O funcție adaptor de ARNt. Interacțiunea codon-anticodon. Structura și rolul ribozomilor în sinteza proteinelor.
Un rol adaptor de ARNt.
ARNt este doar mediator între 4 secvență alfabetică a acidului nucleic și 20 secvență de proteină lettered. Fiecare are o secvență specifică triplet ARNt în bucla anticodon (anticodon) și se poate atașa numai astfel AK, care corespunde anticodon. Este disponibilitatea unui anticodon ARNt în depinde, la rândul său de ceea ce molecula de proteină AK, din moment ce sau un ribozom sau ARNm nu recunosc aminoacizi. Astfel, rolul tARN este un adaptor:
1) în legarea specifică cu aminoacizi,
2) într-un anumit, în funcție de interacțiunea codon anticodon, legarea ARNm
3) includerea aminoacizilor în lanțul proteic în conformitate cu informațiile de ARNm.
Aderarea AK la ARNt este realizată de enzima aminoacil-ARNt sentetazoy având specificitate simultan două conexiuni: un AK-one și ARNt corespunzătoare. Pentru reacția necesară două comunicare ATP bogată în energie. AK este atașat la capătul 3 '
reacția de sinteză a aminoacil-ARNt
pentru că Există aproximativ 60 ARNt diferite, unii aminoacizi corespunde la două sau mai multe ARNt. Diferitele ARNt, se alăture un aminoacid, numit isoacceptor.
Interacțiunea codon-anticodon.
interacțiune codon-anticodon - această metodă de recunoaștere a triplet (care este m-ARN) tripletul complementar (este anticodon) care constituie m-ARN corespunzător.
Codon și anticodon pereche mod antiparalel (teorii wobble Crick):
1. Primele două baze de perechi de codoni formează baze puternice de azot cu anticodon corespunzătoare.
2. situat în poziția a treia a codonii bazelor azotate formează legături de hidrogen cu anticodon slab.
3. Concluzie Crick: sunt în poziția de bază a treia dintre cele mai codoni au un anumit grad de libertate în formarea unei perechi cu anticodon bază de azot corespunzător - aceasta este baza de balansare.
4. Este această interacțiune cu codon anticodon prevede includerea de aminoacizi în situsurile corespunzătoare ale lanțului polipeptidic al proteinei sintetizate.