Structura Peptidele
Informații generale despre structura peptidei
Fig. 4.1 prezintă o tripeptidă care constă din resturile de aminoacizi ale alanină, cisteină și valina. Rețineți că tripeptida conține trei reziduuri, dar nu și cele trei legături peptidice.
Fig. 4.1. Formula structurală a tripeptidă. legături peptidice sunt umbrite pentru claritate.
Acesta este utilizat pentru a reprezenta structura peptidei, astfel încât rest N-terminal (care conține o grupare amino liberă) a fost plasată pe partea stângă și reziduul C-terminal (liber gruparea a-carboxil) - la dreapta. O astfel de peptidă are un singur liber o grupă amino și numai unul o grupare carboxil. Acest lucru este valabil pentru toate polipeptide, care sunt formate prin numai resturile de aminoacizi unite prin legături peptidice formate între o-amino și o grupare carboxil. In unele peptide gruparea amino terminală sau o grupare carboxil terminală este modificat (de exemplu, poate servi ca un derivat acil sau o amidă a unei grupări amino a unei grupări carboxil) și, prin urmare, nu este liber.
Peptidele de înregistrare formula structurală
Să subliniem cel mai simplu mod de a înregistra. În primul rând, remiză „coloana vertebrală“ a strâns legat unul cu altul și de la atomii de carbon. Aceste grupuri alternează de-a lungul lanțului de coloana vertebrală. Apoi conectați la atomii de carbon ai grupurilor laterale respective. Vom descrie această procedură mai detaliat.
1. trage o linie în zig-zag de lungime arbitrară și se adaugă stânga gruparea amino N-terminală:
2. încorporat în atomii un lant de carbon și carboxil și gruparea a-amino:
3. învecina corespunzătoare -în (care sunt umbrite) și hidrogen atomii la atomii de carbon:
Fig. 4.2. Reprezentarea structurii primare a hexapeptidul folosind trei litere și cu o literă denumirile de resturi de aminoacizi. Acest hexapeptide conține pe capătul N-terminal glutamat (Glu. E). și alanina C-terminală
Structura primară a peptidei
Secvența lineară a resturilor de aminoacizi din catena polipeptidică numita structură peptidică primară. Pentru a determina structura primară a polipeptidei, este necesar să se stabilească numărul, structura chimică și ordinea tuturor resturilor de aminoacizi din compoziția sa.
Polipeptidele (proteine) pot conține 100 sau mai multe reziduuri, cu toate acestea formulele structurale tradiționale sunt incomod pentru a reprezenta structura primară. „Cursivă chimice“ utilizează fie trei litere sau notație singură literă aminoacizi, desenată în a doua coloană a tabelului. 3.3 (Fig. 4.2). Când denumiți derivatul peptidic este tratat ca restul de aminoacid C-terminal.
Dacă structura primară este stabilită în mod unic, denumirile de trei litere de resturi de aminoacizi unite prin liniute. desemnări de o singură literă nu sunt conectate liniuțe. Dacă o parte a lanțului polipeptidic al secvenței exactă a resturilor de aminoacizi nu este cunoscută, aceste reziduuri sunt închise în paranteze și separate prin virgulă (fig. 4.3).
Fig. 4.3. Heptapeptid porțiune care conține, structura exactă primară care nu este instalat.
Efectele fiziologice ale modificărilor structurii primare
Înlocuirea tuturor unui aminoacid pentru altul în secvența liniară a 100 sau mai mulți aminoacizi pot conduce la o reducere sau pierdere completă a activității biologice a peptidei, deoarece acest lucru ar avea consecințe grave (de exemplu, anemia celulelor in secera; vezi capitolul 6 ..). Multe tulburări metabolice ereditare cauzate tocmai prin substituții singulare de acest tip. Odată cu dezvoltarea unor noi metode puternice pentru determinarea structurii proteinelor și ADN-ul a învățat baza biochimice a multor boli ereditare asociate cu tulburări metabolice.