„Fold“, o captură de ecran a jocului. Săgețile arată:
Proprietățile lanțurilor proteice sunt: 1 - prea strâns distanțate atomi; 2 - legătură de hidrogen; 3 - rest de aminoacid hidrofob; deoarece nu este protejat (de exemplu, nu este ascuns în interiorul moleculei de proteină), pe ea „atârnă“ picăturii galben; 4 - rest de aminoacid hidrofil; 5 - un segment al proteinei „creasta“ (adică lanț principal) având crescut de energie și, prin urmare, un roșu dedicat.
Instrumente jucător: 6 - „guma“, în care jucătorii pot controla instrumentele automatizate; 7 - „îngheța“ proteină „coloana vertebrală“ de conservare a sitului nemodificat cu modificări în alte regiuni ale proteinei.
Interfața de joc: 8 - un panou care indică starea curentă a jucătorului, inclusiv numărul de puncte câștigate; 9 - o listă a celor mai buni jucători singuri și cele mai bune echipe; 10 - panoul de instrumente și opțiuni suplimentare; 11 - chat-ul pentru a comunica cu alți jucători; 12 - „Carte de bucate“ pentru crearea de noi instrumente automate, sau „rețete“ pentru a lucra cu proteine.
Recent, o echipa de cercetatori americani a creat un joc util on-line numit „ori mai mare» (Foldit - «Adună-l"). Joaca-l, vă poate ajuta la progresul științei, care pot participa nu numai absolvenți, dar, de asemenea, la muritorii de rând. Sunteți invitat să reshitodnu dintre cele mai importante, extinse și obositoare sarcini în biologie - pentru a determina conformația corectă a proteinei în secvența sa primară. Dar în joc împotriva plictiselii a fost plecat. Pe ecran - lanțul multicoloră, care ar trebui să stabilească în conformitate cu anumite reguli. Pentru se adaugă puncte decizie corectă, fiecare jucător are propriul său de rating. Vă puteți alătura grupuri și de a rezolva problemele împreună - și, în același timp mișcare biologia înainte.
Este cunoscut faptul că proteina din ei, starea „nerăsucite“ primar - este pur și simplu un lanț liniar de aminoacizi. Fiecare aminoacid din acest lanț are anumite proprietăți - poate fi hidrofile sau hidrofobe, incarcate pozitiv sau negativ, și așa mai departe.
În funcție de proprietățile aminoacizilor lor incep sa interactioneze. resturile de aminoacizi hidrofobi lipesc unul de altul și să se ascundă în interiorul unei molecule de proteine, în cazul în care nu există apă. reziduuri hidrofile ca scoate în afară, deoarece apa conținută în citoplasmă ei nu un pic înfricoșător. aminoacizi încărcați oppositely sunt atrase, și la fel de taxat - resping. Acolo unde este posibil, între aminoacizii având punți disulfurice și legături de hidrogen.
Ca rezultat al tuturor acestor interacțiuni, lanțul proteic începe să se îndoaie și ori, până când în final se ajunge la o astfel de conformație la care „acord“, în orice moment din aminoacizii. În această stare, energia internă a unei molecule de proteină este minimă.
S-ar părea că nu este nimic mai ușor decât pentru a calcula ceea ce conformația proteinei voinței, pe baza secvenței sale de aminoacizi. Dar nu a fost! există și o posibilă numai conformației numai pentru proteinele destul de scurte și simple. Proteina este mai lung, mai conformații diferite poate lua, dar numai unul dintre ele este corectă. Și, ca urmare a unui savant sărac este lăsat singur cu o secvență de foarte lung de aminoacizi care s-ar putea obține zece moduri diferite.
Desigur, există un program special numit „Rosetta“. care calculează conformații corespunzătoare a proteinei bazată pe secvența de aminoacizi (sau proteină în mod alternativ, selectarea secvenței optime în structura sintetizată artificial). Dar - vai! - și „Rosetta“ face greșeli. Aparent, computerul este de multe ori pur și simplu nu se poate calcula structura corecta de proteine, deoarece gândirea spațială umană și intuiția necesară pentru acest lucru.
Un grup mare de oameni de știință americani au decis să abordeze problema de cealaltă parte și rândul său, sarcina plictisitoare si doar neohvatnuyu (pentru proteine - sute de mii), într-un joc interesant.
Un puzzle în care trebuie mai întâi lanțul proteic „untwist“, si apoi ori in mod corect. Imaginea articolului în discuție în natură
Regulile de joc sunt simple: secvență de aminoacizi dată și player-entorse și incolaceste ei, atâta timp cât ea nu va primi optim structura tridimensională. Pentru a introduce un novice în leagăn de lucruri, există mai multe Brainteasers de formare, puzzle-uri, rezolvarea pe care, puteți înțelege elementele de bază ale jocului. Pentru a asmuți activitatea participanților, dezvoltatorii au creat un clasament al celor mai buni jucători (și, după cum sa dovedit, unii dintre cei mai buni jucători implicați profesional în biochimie). În plus, pentru a rezolva puzzle-ului, poți nu numai singur, dar, de asemenea, pentru întreaga echipă.
După cum sa dovedit, de multe ori oamenii să facă față unui puzzle propus este mai bun decât „Rosetta“ - mai ales atunci când, în scopul de a atinge conformații corespunzătoare a descoperi inițial ușor lanțul de proteine, cu rezultatul că energia este crescută. Programul în astfel de cazuri a ajuns la un impas și a dat afară decizia greșită, pentru că a fost „marcat“, care crește energia - ceva nedorit. Cu toate acestea, pentru oamenii nu era o problemă, pentru că știau că după trecerea lanțului în modul dorit, energia sa scade din nou. În plus, fiecare persoană aplicat tactici sale unice pentru a face față provocărilor, precum și programul în orice moment, a acționat în același mod.
testul orb a arătat că cele zece puzzle-uri propuse oameni au făcut față cu sarcina mai bine decât „Rosetta“, în cinci cazuri, două cazuri câștigate de calculator, iar trei cazuri poate fi numită o remiză. Dezvoltatorii cred că opțiunea ideală ar fi de a combina „ori“ și „Rosetta“, astfel încât oamenii nu trebuie să te pui cu punerea inițială a lanțului de proteine, ceea ce poate face un calculator bun și de a ajunge la locul de muncă doar atunci când nevoia ochiului uman pentru alte pliere proteine.
Site de jocuri: fold.it/portal. Pentru a începe jocul, trebuie să vă înregistrați și a pus pe un program special de calculator. Pentru a afla cum să facă tot ceea ce este scris aici.
și nu pot deschide programul după descărcarea acestuia, deși se spune că programul este de asemenea potrivit pentru Vista
((
Auzit în America de așteptat virusul la nivel molecular sau atomic. Ei au cerut punctul cu coordonatele specifice în jurul unui atom sau molecule și calculul au fost de a schimba intensitatea câmpului electromagnetic, care variază în funcție de mișcarea atomilor sau într-un fel diferit? Am citit un tabel care se bazează pe experimente in electronvolți privind interacțiunea dintre atomi și molecule simple. O mulțime de informații găsite pe himik.ru, dar nu toate încerca să pună zhalko.Igru. Poate fi, probabil, proiectat numai pentru tratamentul de dimensiuni mai mici și propulsat de alți atomi și molecule pot fi chiar mai bine de colectare atom la atom. Programku pot aduna pentru shkolnikov.Da să se răsucească brațul pragurilor de energie molecula de energie de legare de ruptură și mn.dr.V „ev“ sau citit despre un experiment ca ceva devine clar. Poate că printre elevii există astfel încât rezultatele unor experimente vor veni cu multe experimente noi. Nu putem fi toți teoreticienii.
Și unde energia desfacerii? Acest lucru ei cred? Dacă destramare - stadiul actual al procesului, atunci este nevoie de o sursă de inițiatoare ( „Match“) și reacția în lanț. Există un sistem real, posibilitatea de a folosi energia unei molecule pentru descurcare altele? Adică, dacă există un mecanism de punere în aplicare o reacție în lanț? Și dacă există un sistem real, mecanismul de „aprindere“ reacției și energia pentru ea? Dacă răspunsul la cel puțin una dintre aceste întrebări este nu, atunci molecula este formată nu optim, și într-un minim local. Dacă totul este, rămâne o întrebare mai mult. Moleculele nu plutesc în reactor ideal, dar într-un mediu real. Care este randamentul energetic al reacției? Acesta acoperă pierderea? Dacă nu, atunci vom obține amestecul optim și forma optimă. Astfel, sarcina adaugă mai mult de un singur factor. Sau nifiga datele brute nu corespund configurației inițiale a moleculelor reale (de exemplu, ele sunt sintetizate direct în cea mai bună formă)? Apoi, aceste întrebări nu se referă la problema. Și este posibil pentru a studia forma de molecule de proteine experimental?