Jonathan sa străduit să protejeze secretul fiului său. inclusiv aproape asasinarea unui reporter care urma să expună secretul lui Clark la întreaga lume și să încheie o înțelegere cu Jor-El, care la costat, în cele din urmă, viața lui.
Inima lui Jonathan a fost tensionată când a fost străpuns cu toată puterea lui Clark. El a decis să candideze în funcția de senator din Kansas împotriva lui Lex Luthor. Jonathan a primit un scaun senatorial, dar după o ceartă cu Lionel Luthor, pe care el a considerat încearcă să folosească abilitățile lui Clark, când a suferit un atac de cord și a murit.
A fost îngropat în Cimitirul Smallville lângă ferma familiei sale. Uneori, spiritul lui Jonathan îl vizita pe Clark și chiar și-a urmat nunta. Spiritul lui Jonathan a apărut ulterior în Cetatea Solitudinii, pentru a prezenta costumul lui Clark Superman. amintindu-i fiului său să nu uite niciodată despre Smallville.
Jonathan Kent în primul sezon
Jonathan Kent în sezonul 5
Spiritul lui Jonathan Kent în sezonul 10
Sacalul lui Jonathan a fost purtat eronat de Perry White pentru că nu știa că el a aparținut lui Jonathan și purta odată Clark.
Jonathan era un fermier, toată viața lui; Ca rezultat, el a fost puternic față de etica muncii și valori morale foarte înalte. El credea că oamenii ar trebui să fie cinstiți, etici ca el însuși, cinstiți și sinceri. Jonathan era aproape de tatăl său, dar în cele din urmă sa hotărât să stea în Smallville, pentru că știa că tatăl său avea nevoie de el pentru a-și ajuta ferma. A devenit furios pe tatăl său, și de momentul în care Hiram a murit, Ionatan a avut o mulțime de lucruri el a trebuit să spună, și a trăit toată viața în regretul față de prăbușirea relației lor.
Jonathan era un tată ferm, dar îngrijitor. El a fost extrem de influent în a ajuta Clark să se adapteze abilităților sale și să se descurce cu alții. Jonathan a fost strict cu Clark, cu așteptări mari și de încredere în el pentru a lua decizii informate și responsabile, dar și pentru că Clark au comportat bine manierat și ascultători, ei încă mai au o relație foarte strânsă. Îl aprecia foarte mult pe Jonathan și adesea îi spunea că dorește să fie ca el. El a crezut întotdeauna Jonathan lui „reale Otomi“ și cu experiență mare de anxietate din cauza moștenirii sale Kryptonian și destin, dar Jonathan este întotdeauna asigurat Clark că el a fost responsabil pentru propriul lor viitor, și a încurajat Clark pentru a alege propria cale. Jonathan era gata să sacrifice aproape totul pentru a-și proteja familia, inclusiv cu prețul propriei sănătăți.