Manifestările pot apărea în mod tipic, atipic sau cronic.
• O infecție tipică. După intrarea în organism, agentul infecțios se multiplică și provoacă dezvoltarea proceselor patologice caracteristice și a manifestărilor clinice.
• Infecție atipică. Agentul cauzal se înmulțește în organism, dar nu provoacă dezvoltarea proceselor patologice tipice, iar manifestările clinice sunt de un caracter indistinct, șters. Atipicitatea procesului infecțios poate fi cauzată de o virulență redusă a agentului patogen, de o contracarare activă a factorilor de protecție cu potențialul său patogen, de efectul terapiei antimicrobiene și de o combinație a acestor factori.
• Infecția cronică se dezvoltă de obicei după infectarea cu microorganisme capabile de persistență prelungită. Într-o serie de cazuri, sub influența terapiei antimicrobiene sau sub acțiunea mecanismelor de protecție, bacteriile sunt transformate în forme L. În acest caz, ei pierd zidul celular, și cu acesta structurile recunoscute de AT și servind ca ținte pentru multe antibiotice. Alte bacterii sunt capabile să circule în organism pentru o lungă perioadă de timp, "lăsând" din cauza acestor factori datorită mimicii antigenice sau modificărilor structurii antigenice. Situații similare sunt, de asemenea, cunoscute sub numele de infecții persistente [de la Lat. persistă, persistă, supraviețuiesc, supraviețui]. La sfârșitul chimioterapiei, formele L se pot întoarce la tipul original (virulent), iar speciile capabile de persistență prelungită încep să se înmulțească, ceea ce provoacă o exacerbare secundară, recidivă a bolii.
• Infecții lente. Numele în sine reflectă lent (de multe luni și ani) dinamica unei boli infecțioase. Agentul cauzal (de obicei un virus) penetrează corpul și există latent în celule. Sub influența diverșilor factori, agentul infecțios începe să se înmulțească (rata de reproducere rămâne scăzută), boala are o formă pronunțată clinic, a cărei severitate crește treptat, ducând la moartea pacientului.
O varietate de microbi rezistă efectelor factorilor de protecție și colonizează cavitățile nesterile ale diferitelor organisme. Supraviețuirea pe termen lung în compoziția comunităților microbiene este posibilă nu numai saprofică și oportunistă (formând o microfloră normală), ci și unele specii parazitare.
• În unele cazuri, dezvoltarea de reacții imune îi lăsă agentul patogen capacitatea de a-și realiza pe deplin proprietățile patogene, dar sunt neputincioși să-l elimine din organism. Astfel se formează bacteriocarrierul.
• Patogenia unui număr de boli infecțioase ca factor de conducere include o circulație prelungită a agentului patogen (de exemplu, agenți cauzali ai sifilisului, tuberculozei, brucelozei etc.). Supraviețuirea pe termen lung în organismul gazdă determină în mare măsură capacitatea agenților patogeni de a "scăpa" de acțiunea factorilor de protecție (de exemplu, prin schimbarea structurii antigenice sau prin mimica antigenică).