La începutul anilor 1980, în țară au început protestele deschise împotriva dictaturii militare. Economia a căzut într-o depresie profundă, din care cauza se afla în scăderea prețului cuprului mondial din 1980, precum și necesitatea de a plăti dobândă pentru datoria externă a Chile și cheltuielilor militare mari. În 1987, junta a fost nevoită să legalizeze partidele politice.
Încercările de guvern civil pentru a ridica problema de a aduce în fața justiției pe cei responsabili pentru numeroase încălcări ale drepturilor omului au întâmpinat rezistența rigid din armată, dar a fost observat progrese în acest domeniu. Creat cu comisia specială de guvern Aylwin ar putea efectua o autopsie a gropilor comune și să se înregistreze în mod oficial aprox. 3000 de cazuri de "dispariție" a oamenilor în timpul domniei lui Pinochet. Apariția unui document oficial făcut posibilă părinții, copiii și soții ale victimelor dictaturii militare de a prezenta creanțe în instanță și să ceară plata prestațiilor relevante. În plus, guvernul lui Aylwin a eliberat cca. 380 de prizonieri politici și au contribuit la întoarcerea a aproximativ 40 000 de refugiați politici în patria lor.
În ciuda discursurilor separate și a demonstrațiilor stradale organizate în semn de protest de către unitățile armate, guvernul civil a revizuit o serie de prevederi ale legii amnistiei; în plus, a reușit să schimbe situația existentă atunci când toate infracțiunile comise de armată în raport cu civilii ar trebui luate în considerare numai de instanțele militare. Peste 20 de ofițeri de poliție și armată au servit și execută pedepse cu închisoarea pentru crimele comise în timpul dictaturii militare.