Chimie și Tehnologie Chimică
În acest fel. structura acidului nucleic determină structura moleculei de proteină. Structura moleculei de proteine determină forma și modul de influență asupra proceselor activității vitale. Cu alte cuvinte, rolul determinant jucat de forma și dimensiunea moleculelor din biologie este din ce în ce mai dezvăluit. [C.1065]
Și gloria actuală nu are nimic de-a face cu asta. Acum se vorbește foarte mult despre el, cel mai adesea cu respect și, probabil, într-o zi el va rămâne la egalitate cu Rutherford și Bohr. Dar nimic ca acest lucru nu a fost în acele zile, atunci când toamna anului 1951, am ajuns la Laboratorul Cavendish de la Universitatea din Cambridge și sa alăturat unui mic grup de fizicieni și chimiști, care au studiat structura spațială a moleculelor de proteine. Plânsul avea treizeci și cinci de ani și totuși era aproape necunoscut nimănui. Deși colegii muncitori l-au recunoscut mintea tenace și profundă și de multe ori a apelat la el pentru sfat, este adesea subestimat, și mulți au crezut că el era prea vorbăreț. [C.13]
Am fost din ce în ce mai fascinat de structura spațială a moleculelor. M-am gândit că poate, ca Pauling și-a construit a-helix-ul pentru proteine și voi putea să construiesc ceva asemănător unei gene, adică pentru ADN. [C.137]
Pe baza faptelor cunoscute că IRI orice pH (de exemplu, o semnificație fiziologică IRI 7,35), tăria ionică, constanta dielectrică, și chiar aminoacizi și proteine pot exista în diferite stări de ionizare, poate fi de așteptat. că aceste molecule vor interacționa cu mediul apos datorită formării legăturilor ionice (electrostatice) și hidrogen. De aceea fiecare proteină are propriul grad de hidratare specific sau, cu alte cuvinte, trebuie să contacteze o anumită cantitate de apă pentru a-și menține întreaga structură. Molecule [c.43]
Condiții structurale și termodinamice pentru mecanismul de convergență și orientare în cataliză enzimatică. Deci, pentru eficiența cataliză este important să înghețe reacția dintre X și centre Y, care are loc în complexul XE-RY (și însoțește formarea legăturii ER), ca o reacție la starea de tranziție XY mult posibil mai aproape de acest lucru este necesar ca structura sitului activ suprem a fost complementară structurii moleculei de substrat, pe care trebuie să o ia în starea tranzitorie a reacției. Acesta este motivul pentru care centrul activ al enzimelor este situat, de obicei, în pliuri de lanțuri de polipeptide. formând un gol. Undeva în adâncimile acestui spațiu sunt reziduurile de aminoacizi care interacționează cu substratul. Datorită acestei structuri a centrului activ în trecerea de la molecula de substrat svobodnodvizhuschegosya stat (din soluție), o stare sorbit (când este, figurat vorbind, stors în site-ul activ) apare necesară pentru a îngheța reacțiile grade de rotație de libertate și convergența cu grupările active catalitic ale proteinei. [C.56]
Deja în 1926-1929. . Premiul Nobel J. și J. Sumner, Northrop au izolat in enzime in forma cristalina - ureazei, tripsina și pepsina, care a fost găsit pentru a reprezenta o proteină pură. În anii 1930, enzime intracelulare au fost izolate - enzima galbenă Warburg și alcool dehidrogenază obținută sub formă cristalină. Numărul de enzime izolate în formă cristalină a crescut constant de atunci. În același timp, au apărut noi dovezi ale naturii sistemice a enzimelor. constând dintr-o parte proteină (apoenzimei) și porțiunea nonproteinici (CoA), care să asigure integritatea structurii moleculare a enzimei și unitatea sa de acțiune catalitică. [C.180]
ZI este imposibil, iar atomii localizați direct în legătura peptidică. se află în același plan. Această circumstanță are o mare importanță, deoarece determină în mod fundamental structura spațială a moleculelor de peptide și proteine. [C.191]
Fig. 49. Imaginea structurilor secundare (a) și terțiare (6) ale moleculei de proteină (în schema structurii terțiare, răsucirea structurii secundare în spațiu în a-helix este clar vizibilă).
Ambele etape nu pot fi separate unul de altul. Esența denaturării termice poate fi luată în considerare în cazul proteinelor globulare. Molecula de bază a proteinei globulare. după cum se cunoaște, constă din una sau mai multe lanțuri polipeptidice. pliuri îndoite și încurcări de formare. O astfel de structură este stabilizată de legături slabe, dintre care legăturile de hidrogen joacă un rol important. Formarea de punți transversale între lanțurile peptidice paralele sau pliurile acestora. Atunci când proteinele sunt încălzite, lanțurile polipeptidice sau pliurile acestora sunt intensificate, ceea ce determină ruperea legăturilor slabe între ele. Drept urmare, se observă plierea și regruparea pliurilor, însoțite de redistribuirea radicalilor polari și nepolari, cu radicali nepolari concentrați pe suprafața globulelor. scăzând hidrofilicitatea și, în consecință, solubilitatea. [C.370]
Primul este rezolvat de fizica modernă cu noțiunea de explozie mare. în care particulele elementare au format materie. În același timp, este uitat. că trebuie să existe un impuls primar al Creatorului la crearea lumii. În plus, teoria Big Bang susține că inițial toate au apărut din quanta luminii. Și aceasta confirmă Biblia Și Dumnezeu a spus Să fie lumină. Și era lumină. Din punctul de vedere al științei moderne a vieții, ca fenomen al naturii. nu ar trebui să fie. Creați o structură de molecule de proteine sau ADN - purtătorul principal al informațiilor dintr-un set de molecule simple este ca și cum ați tăia textul acestei publicații în scrisori separate și așteptați când se utilizează temperatura. presiunile sau catalizatorii pe care îi vor aduna în articole, iar articolele se transformă într-un număr. Argumente similare sunt exprimate de mulți oameni de știință din Occident și, din păcate, puțini în țara noastră. [C.31]
Prima proteină a cărei structură a fost decodificată a fost insulina hormonală. reglementând metabolismul zahărului în organism. Zece ani au fost cheltuite pentru această lucrare de către biochimistul englez Frederick Sanger, pentru care i sa acordat Premiul Nobel pentru anul 1958. Este, în special, a constatat că formula de insulină și moleculei sale constă din două lanțuri (unul care conține 21 și celelalte - resturile de aminoacizi 30) într-o secvență de legături -S-S- interconectate. [C.269]
Constantele de echilibru diferă nesemnificativ (în 2-4 ori). În același timp, în timpul tranziției de la proflavine la proces 6Q colorant rodamină complexare cu situsul activ incetineste aproape 10 structuri moleculare paat ale acestor liganzi diferă în mod esențial numai prin aceea că molecula cuprinde rodamină 6Q suplimentar inel benzen. Așa cum se arată în studiul dependenței de temperatură a cineticii complexării. Energia de activare a acestui proces este de aproximativ 17 kcal / mol (71,4 kJ / mol). Pe de altă parte, se știe că energia de activare a proceselor. controlat prin difuzie, nu depășește, de regulă, 5 kcal / mol (21 kJ / mol) [62, 63]. Prin urmare, trebuie să concluzionăm că formarea unui complex cu chimotripsina vrac rodamin molecula 6G este posibilă numai ca urmare a modificărilor conformaționale în molecula de enzimă. Un astfel de mecanism (1.8) al complexării moleculelor organice cu proteine pare să fie foarte comun. [C.31]
Această circumstanță determină posibilitatea utilizării difracției cu raze X pentru a determina structura moleculelor din cristale. Cristale fabricate din molecule complexe. oferă o imagine foarte complexă a distribuției intensităților reflexelor individuale. Cu toate acestea, poate restabili complet locația atomilor individuali într-o celulă unică și prin aceasta să stabilească structura spațială completă a moleculelor. din care este construit un cristal. Folosind câteva tehnici suplimentare și aplicând mașini de numerotare electronică de mare viteză pentru calcule, este posibilă obținerea structurii spațiale chiar și a unor astfel de molecule complexe. ca proteine și acizi yaucoici. [C.163]
Ioni de clor formează o rețea. care este identică cu zăbrele. formată de ioni de cesiu. Prin urmare, reflecțiile din avioane conținând ioni de clor. sunt posibile exact la aceleași unghiuri ca și de la planurile care conțin ioni de cesiu. În cazul în cauză, planurile de ioni de clor sunt localizate exact în mijloc între planurile de ioni de cesiu. iar distanța dintre aceste planuri este // 2. Prin urmare, valurile reflectate din planul ionilor de clorură vor fi deplasate în comparație cu valurile reflectate din planul învecinat al ionilor de cesiu cu o valoare Sn0. Pentru n n, aceste valuri sunt mutate la jumătatea valului și se anulează reciproc. Cu toate acestea, datorită diferențelor în amplitudinea oscilațiilor de dispersie (este mult mai mic pentru ionii de clor mai puțin intensiv împrăștiați), călirea va fi incompletă, adică se observă reflexe. Pentru chiar n, valurile împrăștiate de pe ambele planuri coincid în fază și împrăștierea de la ionii de clor va crește într-o oarecare măsură împrăștierea din ionii de cesiu. Prin urmare, împrăștierea din sistemul de avioane. care conține fețele celulei unității. mai intens la unghiuri de 22 și 48,52 °, decât în celelalte trei unghiuri. Dispersia dintr-un sistem de avioane. care conține diagonalele fețelor celulei unității. la un unghi de 31,95 ° este mult mai puternic decât la unghiurile de 15,34 și 52,54 °. În consecință, distribuția intensității între reflexe conține informații despre distribuția atomilor în celula unității. adică structura particulelor. constituind celula. Această circumstanță determină posibilitatea utilizării difracției cu raze X pentru a determina structura moleculelor din cristale. Cristale fabricate din molecule complexe. oferă o imagine foarte complexă a distribuției intensităților reflexelor individuale. Totuși, aceasta poate restabili complet locația atomilor individuali într-o celulă unică și prin aceasta să stabilească structura spațială completă a moleculelor. din care este construit un cristal. Folosind câteva tehnici suplimentare și aplicând pentru calcularea calculatoarelor de mare viteză. este posibil să se obțină structura spațială chiar a unor astfel de molecule complexe. ca proteine și acizi nucleici. [C.185]
Activitatea suprafeței proteinelor. ca multe dintre funcțiile lor, depinde de așa-numita structură terțiară a moleculelor de proteine, care se datorează ambalării spațiale a lanțurilor lor polipeptidice. Această structură terțiară a moleculei, la rândul ei, depinde de structura primară - secvența de aminoacizi din moleculă, determinată de aparatul genetic al celulei. Suprafața globulei albe este de natură mozaică - conține regiuni polar și nepolar, în timp ce proporția acestor și altele este aproximativ aceeași, ceea ce este tipic pentru toate proteinele, inclusiv proteinele membranare. [C.97]
O modalitate oarecum excelentă este folosită pentru a repara deteriorarea ADN-ului, ceea ce perturbă în mod semnificativ structura moleculei. de exemplu, dimerii de pirimidină. format sub influența ultravioletului. Astfel de daune înlătură enzima special - iugAVS endonuclease (în întuneric, atunci când nu funcționează, sau când photolyase daune ADN-ului mult) și nucleaza-fosfo pauze dnefirnye comunicare cu 5 - și sfârșitul porțiunii deteriorate W“, iar apoi folosind o proteină Iugo , helicase AND, site-ul deteriorat este îndepărtat împreună cu hidroliza ATP. Fragmentul rezultat a generat ADN polimeraza I (Figura 46). [C.78]
In 1902, medic britanic AE Garrod (1857-1936) au investigat FR la care urina întunecată pe picioare în aer, și a constatat că decolorarea cauzată de prezența în urină acidă ing sau gomogentizino acid 2,5-dihidroxifenilacetic . El a descris acest fenomen ca o eroare metabolică congenitală. Mai târziu, sa constatat că acesta este rezultatul unei mutații genetice a enzimei. care transformă acidul homogentisic în corpul unei persoane sănătoase în alte substanțe. la pacienți sau nu sintetizați deloc sau, eventual, sintetizați într-o formă modificată. care nu au activitate catalitică. În 1949, a fost descoperită cauza altei boli genetice, anemia cu celule secerătoare. care se datorează prezenței în organism a unei gene mutante care determină sinteza unui lanț polipeptidic anormal de hemoglobină. Moleculelor hemoglobinei lant la pacientii cu boala de celule secera este un înlocuitor de un rest de aminoacid acid glutamic la valină, care a fost deja descrisă în secțiunea. 15.6. Deoarece apariția moleculelor anormale de hemoglobină implică o boală, anemia cu secera a fost numită boală moleculară. Din 1949, sute de boli moleculare au fost descoperite. Pentru multe dintre ele, se stabilește natura mutației genei și modificarea corespunzătoare a structurii moleculei de proteină, dependentă de gena mutantă. Pentru o serie de astfel de boli, detectarea tulburării la nivel molecular a făcut posibilă explicarea aproape complet a simptomelor bolii. [C.467]
Succesuri uriașe în cercetarea mecanismelor de codificare a informațiilor ereditare și a biosintezei proteinelor. enzimatic cataliză și reglarea activității enzimatice. acțiunea antibioticelor și a hormonilor, toate domeniul de studiu al celor vii, denumit în mod obișnuit biologie moleculară, a învățat toată lumea să creadă că în viața structurii moleculare a fiecărei poziții atom doar strict din cauza și este condiționată de punerea în aplicare a acestor molecule sunt destinate pentru funcțiile biologice. Este în atomul este acceptat de obicei sens pentru a vorbi despre specificul biopolimerilor, este ferm asociat în mintea cercetătorilor la-o corespondență între structura și funcțiile îndeplinite. Cu un astfel de complex, vezi paginile în care termenul "proteine" se referă la structura unei molecule. [C.193] [c.169] [c.585] [c.593] [C.8] [c.270] Handbook Biochemical (1979) - [C.16]
Chimia compușilor cu înaltă moleculară (1950) - [c.469]