Muammar Gaddafi sa căsătorit de două ori. În 1969, aproape imediat după ce a venit la putere, sa căsătorit cu fostul profesor și cu fiica ofițerului libian Fathia Nouri Khaled.
Căsătoria era de scurtă durată. Cu toate acestea, în el sa născut fiul său mai mare Mohamed.
Saif al-Islam sa născut în 1972. A absolvit Universitatea Al-Fateh cu diplomă în arhitectură și inginerie, apoi a studiat la școala internațională de afaceri IMADEC din Viena (Austria) și la Școala din Londra de Economie.
Al treilea fiu, Saadi Qaddafi (născut în 1973) a fost colonel al armatei libiene și un jucător profesionist de fotbal. A jucat pentru cluburile italiene Perugia și Udinese și, de asemenea, a condus federația de fotbal libiană.
Al patrulea fiu - Hannibal Muammar Gaddafi (născut în 1975) a lucrat în cadrul Companiei Naționale de Transport Maritim General, o companie de export a petrolului libian.
În plus față de copiii nativi, Muammar Gaddafi au fost două mai maternală fiica Hannah, care a murit în 1986, iar nepotul lui Milad Abuztayya Gaddafi. Se crede că Milad a salvat viața lui Muammar Gaddafi, când avionul american a bombardat reședința liderului libian.