markeri genetici moleculari
marker genetic molecular - un sistem complex reprezentat de doi factori. Prima dintre ele - o secvență de nucleotide unică, făcând posibilă harta cu precizie cromozomul dorit. Al doilea factor - prezența în vecinătatea unei porțiuni predeterminate a elementului cromozomială sau intra (sau inter) polimorfismului.
Genetic polimorfismului - o modificare în secvența de nucleotide a markerului ADN-ului, cauzate de diferitele tipuri de mutații (mutații punctiforme, deleții și orice alte reconstrucție cromozom). Forme de exprimare a polimorfismelor genetice sunt numite alele. Natura polimorfice a locusului particular crește cu numărul de alele. Prezența a două sau mai multe alele este o condiție prealabilă pentru utilizarea locus ca un posibil marker genetic.
Una dintre cele mai importante condiții pentru utilizarea markerilor genetici moleculari în creșterea bovinelor cu caracteristicile și proprietățile dorite este cunoașterea trăsăturii genetice bazate. Este necesar, în acele cazuri în care suntem interesați de un semn care nu este determinată de o singură genă, un grup de gene. În același timp, în cazul în care aceste gene nu sunt strâns relație genetică unul cu celălalt, folosind una dintre ele ca un marker genetic molecular devine foarte dificil. Cu toate acestea, este cunoscut faptul că astfel de gene cantitative sunt adesea asociate în așa-numita „cantitativă trăsătură loci» (QTL) și sunt moștenite împreună, ceea ce face posibilă utilizarea unor markeri genetici moleculari.
Caracteristicile unor tipuri de markeri genetici moleculari
substituții unice de nucleotide sau SNP (din engleză Single Nucleotida Polimorfism). substituții SNP dot nucleotide (mutații) sunt cel mai frecvent tip de markeri polimorfici și reprezintă substituția unei nucleotide pentru altul. Incidența - una dintr-o mie de perechi de baze, și numărul total de vaci in genomul ajunge la trei milioane de (unele până la zece milioane). Valoarea și triallelnyh biallelic substituții unice de nucleotide mutat foarte mult spre bialelic deoarece Procentul trialelnyh fracțiune este de o zecime la sută. Prin urmare, markeri SNP au un nivel scăzut de polimorfism și conservatorism evolutiv ridicat.
- sinonim - nu va avea loc pentru o înlocuire a compoziției de aminoacizi a proteinei codificate
- nonsynonymous - alterează compoziția de aminoacizi a proteinelor codificate.
substituțiile unice de nucleotide pot altera activitatea promotorului, influențează conformația ADN-ului și a pre-ARNm, determinarea nivelului de transcriere a genelor si eficienta despicare.
Repetițiile în tandem - este repetarea anumitor secvențe în orientarea „cap la coadă“. Pentru că ei, la un locus repetă același motiv, secvențele au fost numite sateliți.
repetiții în tandem au devenit una dintre cele mai mare informative markeri genetici la animalele de fermă, deoarece numărul de tandem se repeta la animale diferite sateliți variază.
Maksisatellity - lungimea totală a secvențelor repetitive de mai mult de 5 bp
Minisatellites - lungimea totală a fragmentelor este de la câteva mii la 30 mii pb lungime Astfel motive variind zece-șaizeci bp [Jeffreys, 1985].
Microsateliții - lungimea totală a fragmentului de obicei mai puțin de 350 pb, iar lungimea motivului este în mod tipic la doi la șase bp [Tautz, 1989]. Microsateliții sunt ambele transcris și non-transcrise situri ADN.
Din punct de vedere poate fi divizat markeri polimorfici informative la bialelic (substituții unice de nucleotide) și multiallelnye (repetiții în tandem și sistemul dispersat).
În cercetarea noastră ne concentrăm asupra substituțiile unice de nucleotide, așa cum este acestea includ markeri genetici de longevitate la bovine.