Modalități de a proteja catenele laterale ale diferitelor aminoacizi care nu sunt discutate în această carte. așa cum acestea sunt descrise în detaliu în monografiile (vezi referințele citate). Mai important este introducerea la bazele de metode chimice de blocare a grupărilor amino și carboxil, care permite să se tragă concluzii cu privire la principiile de blocare a lanțurilor laterale. Adesea folosite în acest scop sunt identice sau foarte asemănătoare grupărilor protectoare. Ca un exemplu, ia în considerare blocarea tio cisteină și grupările amino de lizină și ornitină [c.78]
Deoarece fiecare aminoacid este atașat la rândul său, este important pentru ieșirea fiecărei etape în sinteza chimică a proteinelor. Referindu-ne din nou la sinteza Gly-Ala, observăm că, atunci când sinteza legăturilor peptidice a fost de 90%, o astfel de sinteză poate fi considerată satisfăcătoare. Cu toate acestea, în cazul în care sunt utilizate aceleași condiții pentru sinteza decapeptidei gramicin S, randamentul total este de 0,9 X 100% = 35%. Aceasta este, indiferent de pierderile în timpul inserției și îndepărtarea grupărilor protectoare. În consecință, sinteza proteinelor macromoleculelor formarea legăturii peptidice trebuie să aibă loc cu un randament ridicat. [C.68]
Ca rezultat, amestec la fierbere de 2-clorciclohexanonă cu fenol în benzen, un hidroxid de sodiu apos și o cantitate mică alikvata Pikker 336 [246] a alocat 58% din 2-nona-fenoksitsiklogeksa K. Produsul de reacție obișnuită nu a fost detectat Tabor (Schema 3.45). Compusul de tip L și M pot introduce metoximetil grupare protectoare. Dacă sarea de potasiu pentru a reacționa cu fenol adecvat hlordime Tilova-ester în acetonitril în prezența a 10 mol.% 18-coroană-6, la temperatura camerei [241]. [C.156]
O metodă clasică pentru îndepărtarea grupării ftalil - Tratamentul gidrazingid-Rath în apă sau etanol. A subprodus. hidrazida, se separă prin precipitare. nucleofil Hidrazina bun (așa-numitul un efecte), grupul ftalil atacator angidridopodobnuyu în condiții care nu sunt afectate de legături peptidice. Cu toate acestea, în prezența unor legături eterice există un hidrazinoliză pericol. Pe celelalte grupe protectoare cu un tratament de hidrazină nu are nici un efect. Tratamentul cu hidrazină în solvenți hidroxil poate fi înlocuit cu un tratament cu fenilhidrazina în alți solvenți organici. caz în care hidrazida rămâne în soluție și aminoacidul precipită. [C.74]
grupare protectoare organometalici (pentacarbonil [metoxi (fenil) ct-ben] crom (0))) a fost propusă pentru protejarea grupărilor aminice. Este ușor de îndepărtat prin acidul triftoruksusioy tratament, la temperatura camerei. Gruparea amino poate bloca, sulfiruya folosind o-nitrofenilsulfohlorida. Release se produce prin acțiunea HK1 dar derivați ai acidului nitrofenilsulfopro-amino trebuie depozitate sub forma unei sări. ca derivat al acidului liber este instabil. [C.76]
In general, acest lucru se realizează prin esterificarea grupării carboxil. să fie protejate. aminoacizi tratat cu metanol sau etanol pentru a produce metil sau etil eter, saturat cu HK1 (esterificare la Fischeru). Cu toate acestea, în general, preferați esterii care conduc ușor hidroliză în condiții blânde. Deși esterii sunt saponificate cu baze sunt mult mai ușor decât peptide (ca alcoxizilor - luchshche grupă labilă) utilizate pentru aceste condiții alcaline nu pot fi utilizate pentru a elibera polipeptide. Folosind benzil-lauril eter permite îndepărtarea grupărilor de protecție în condiții neutre, prin hidrogenare catalitică. benzii esteri lovye sintetizați din alcool benzilic și acid, în prezența unui acid sau tioiilhlorida (care se traduce Sulfoclorura alcool și a înlocuit ultima acidul), [c.77]
Dintre cele trei grupuri care trebuie protejate (amino, hidroxil și fosfat), blocând hidroxil este cel mai important să se minimizeze randamentul produselor secundare și izomeri. Prin urmare, multe grupuri de protecție au fost propuse pentru blocarea hidroxil. O astfel de diversitate este foarte utilă deoarece poate fi necesar să se introducă într-o singură moleculă două grupări hidroxil diferite de blocare. este de obicei necesar în tratamentul 5-hidroxil grup (primar) separat de secundar. În cazul ribonukleotndov afectează selectiv 2 - și W grupări hidroxil -vtorichnye dificile, deoarece acestea au proprietăți chimice similare. [C.158]
Pe baza informațiilor cu privire la diferitele grupe de protecție adecvate pentru blocarea hidroxil și grupările amino pot fi protejate nucleozide sunt sintetizate în care grupările reactive formează numai 3 -fosfodiefirnuyu legătură. Produse nedorite (3, 3 -..., sau 5, 5 -fosfodiefiry fosfo-amide, etc.) nu este format probabil. Indicativ pri- [c.166]
Cea mai recentă revizuire. privind utilizarea grupărilor protectoare fotoactivabili în sinteza organică (aminoacizi, nucleotidă), a se vedea. lucrarea [362]. [C.166]
După reacție, gruparea protectoare poate fi îndepărtată în condiții blânde. Aceasta nu afectează legătura fosfodiester. Aceasta este baza de fosfodiester metoda de sinteză polinucleotide. Produsul de reacție - fosfodiesterice cu un liber, potențial vulnerabile la impact grup incarcate negativ. Mai mult, odată cu creșterea lungimii numărului lanțului de polinucleotide de sarcini negative în compus va crește de asemenea. Prin urmare, în funcție de condițiile de reacție, aceste centre potențial nucleofili pot participa la reacții secundare nedorite. Mai mult, o astfel slischkom repetativ compus polar pentru a fi în măsură să efectueze purificarea prin procedee convenționale ale chimiei organice. de exemplu, prin cromatografie pe silicagel. În schimb, utilizați cromatografia pe medii de schimb ionic având o capacitate mai mică (de exemplu, pe DEAE-celuloză). Metoda fosfodiester este adecvată pentru obținerea de substanțe numai în cantități mici. Cu toate acestea, neutralizarea taxelor prin eterifi-katsii grupări de protecție adecvate înainte de nucleozide fosforilare niem elimină problemele menționate mai sus. În acest caz, produsul reacției de condensare este fosfotriester. Metoda fosfotriester vă permite să lucrați cu cantități mari de substanțe. Următoarele descrie câteva grupări de protecție utilizate pentru blocarea fosfat. [C.167]
Este protejat agent de fosforilare și reyagiruet nucleozid pentru a forma o conexiune -fosfodiefirnoy 3, 5. După terminarea reacției, grupa protectoare triclor etil poate fi îndepărtată în mai multe moduri clasice - o prelucrare de zinc, dar se poate folosi și fluorură de amoniu-tetrabutil [c.168]
Ca și în cazul grupului 2,2,2-tricloretil, deprotejarea poate fi realizată prin tratarea cu fluorură sau hidroxid de sodiu. Evident, grupul de prim rang-clorfenil iese mai bine decât grupul fe / la punct de vedere legal. Atac de ioni de fluor, de asemenea, continuă cu fluorofosfatată educație intermediară. [C.169]
proces side indezirabilă. Metoda triester care apar în timpul sintezei de polinucleotide (m. e. în sinteza mai mult decât dinucleotide, oligomeri), este legăturile de despicare internucleotidelor. Se observă, în mare măsură, după îndepărtarea grupărilor protectoare aromatice prin tratarea cu ion alcalin, sau fluorură [c.169]
Bazat pe acid fosfamida putem presupune că acestea vor fi potențial utile ca grupe protectoare. Într-adevăr, un bine-cunoscut de protecție anilidă pe care le puteți introduce și elimina [c.170]
O metodă similară de sinteză rapidă este de asemenea posibilă ribonucleotide așa cum se arată în exemplul formării uridilil- (3 -> 5) -uridina. În acest caz, ca tricloroetil și grupări silii protectoare pot fi îndepărtate simultan prin dizolvarea triester în soluție de fluorură de tetrabutilamoniu în tetrahidrofuran. [C.180]