Aproape toate proteinele se formează pe ribozomi localizați în citozol. Proteinele aparținând primei ramuri de transport, după finalizarea sintezei lor, sunt eliberate în citozol. Unele dintre ele conțin semnale de sortare. direcționându-le din citozol către mitocondriile, nucleul sau peroxisomii, în timp ce alții - majoritatea dintre ei - nu au semnale specifice de sortare și rămân în componenta citozolului ca componente permanente.
Cea de-a doua cale de transport este utilizată pentru a direcționa proteinele la ER pentru a elimina proteinele din celulă, precum și proteinele trimise către aparatul Golgi. la membrana plasmatică sau la lizozomii. Toate aceste proteine, așa cum s-au format, sunt transferate în ER prin intermediul semnalelor de sortare. localizat de obicei la capătul N-terminal. Ribozom. pe care astfel de proteine sunt asamblate, rămân legate la membrana ER pentru o perioadă scurtă de timp după inițierea sintezei lanțului polipeptidic. Odată ce următoarea secțiune a lanțului polipeptidic este sintetizată, aceasta penetrează prin bilayerul lipidic al acestei membrane. Unele proteine intră apoi în lumenul ER, altele rămân parțial închise în membrană ca proteine transmembranare.
De obicei, nu mai mult de un minut sau două de la momentul eliberării proteinei în citosol înainte de intrarea RQ în organelle corespunzătoare. Proteinele destinate nucleu, mitocondrii sau peroxizomi, aceste organite a ajuns, în acest scop calea lor între proteinele care intră în ER sunt implicate în transportul în continuare, care se crede că ar fi vezicule de transport. Separarea de pe o membrană și fuzionarea cu alta. Se pare că mai multe astfel de cicluri trebuie să apară pentru a ajunge la punctul final, iar calea de la membrana ER la destinație poate dura o oră.
Există două moduri diferite în care proteinele se deplasează de la un compartiment la altul.
În primul rând, ele pot pătrunde direct prin membrană, care intră în spațiul este topologic citosol echivalent, în spațiul care este topologic echivalent cu extracelular, sau invers.
Al doilea mod de mișcare a moleculelor de proteine este mediat de veziculele de transport. Aceste bule captează anumite molecule în cavitatea unui compartiment și le transferă într-un alt compartiment, care se îmbină cu acesta. Acesta este modul în care are loc transferul de proteine solubile de la ER la aparatul Golgi. Cu acest transport vezicular, proteinele nu traversează nici o membrană, deci sunt transportate doar între compartimente echivalent topologic unul cu celălalt.
Ambele tipuri de procese de transport sunt controlate selectiv de proteine speciale, care acționează ca semnale de sortare. Unele semnale de sortare în proteine sunt cunoscute, în timp ce majoritatea receptorilor membranari complementari nu sunt. În plus, nu știm prea multe despre veziculele de transport. Se poate presupune doar că există multe dintre ele, în funcție de diversele transferuri pe care trebuie să le efectueze. Pentru a-și îndeplini funcțiile, fiecare bule trebuie să capteze numai anumite proteine și să se îmbine numai cu o membrană țintă specifică.