Taxonomia, clasificarea și nomenclatorul virușilor

Clasificarea virusurilor este complexă și este în prezent incompletă. Principiile de clasificare a lui K. Linnaeus cu privire la virusuri au fost inacceptabile. Din 1971 lumea a folosit în mod oficial este sistemul de clasificare a virusului universal, bazat pe principiul ierarhic politetic, extins Adanson M. (1727-1806 gg.) - botanistul francez, unul dintre fondatorii sistemului natural al plantelor și aplicarea metodelor matematice în biologie. Conform acestui principiu ia în considerare numărul maxim de semne morfologice, fiziologice, genetice și alte tipuri de virusuri (cel puțin 60), fiecare dintre care are un anumit grad de semnificație. Dezavantajul clasificării adanasonice nu este laboriositatea sa, ci lipsa de informații complete despre mai mulți viruși.

Comenzile pentru viruși sunt grupuri de familii de virusuri cu caracteristici comune care diferă de alte ordine și de familii. Indicat prin nume cu sufixe -virale. În prezent alocate viruși de ordinul a 3 :. Mononegavirales (virusuri cu ARN negativ mono-catenar), Caudovirales ( „coadă“ bacteriofagi), Nidovirales (lat nido - virusuri cuib ca ARN subgenomic despicare transcrise în timpul replicării sub formă de cuiburi ), dintre care doar primul este aprobat de MKTV.

Ordinea Mononegavirales include familii: Paramyxoviridae, Rhabdoviridae și Filoviridae.

Virusurile sunt grupuri de genuri de virusuri cu caracteristici comune care diferă de virușii din alte familii. Denumită de numele cu sufixul - viridae. O familie este un termen care a rezistat testului timpului și nu se schimbă. Acest nivel al ierarhiei taxonomice este o piatră de temelie stabilă. Multe familii de virusuri au o distincție clară între structura virionului, structura genomului și modul de replicare, care determină independența filogenetică sau o structură separată filogenetică.

Subfamiliile se disting în 4 familii: Poxviridae, Herpesviridae, Parvoviridae, Paramyxoviridae - pentru o ierarhizare a taxonului mai complexă. Se utilizează sufixul - virina.

Criteriile utilizate pentru descrierea familiei de viruși conform sistemului de clasificare al lui M. Adanson (luate din ghidul MKTV pentru descrierea familiilor):

Proprietățile virionului. 1. virion morfologie (mărime, formă, prezența sau absența și superkapsida peplomerov, simetrie și structura de capsidă). 2. Proprietățile fizice ale virionului (greutate moleculară, densitate, coeficient de sedimentare, stabilitate pH, stabilitatea temperaturii, cationi (magneziu și mangan) stabilitate, rezistență la solvenți, detergenți și acțiunea energiei radiante). 3. Proprietățile genomului (un tip de acid nucleic, numărul de filamente, liniare sau polaritate circulară, numărul de segmente, mărimea genomului sau segmentele sale, prezența sau absența unui capac pe capătul 5 „prezența sau absența capătul 5“ polipeptidă asociat covalent, prezența sau absența la capătul 3 al secvenței poli (A) sau la o altă secvență specifică, secvența nucleotidică). 4. Proprietățile proteinelor (număr, mărime, activitate funcțională, secvență de aminoacizi). 5. Lipide (prezență sau absență, natură). 6. Carbohidrați (prezență sau absență, natură).

Organizarea genomului și replicarea. 1. Organizarea genomului. 2. Metoda de replicare a acizilor nucleici. 3. Caracteristicile transcripției. 4. Caracteristicile traducerii și prelucrării post-translaționale. 5. Locul acumulării de proteine ​​virion, locul de asamblare, locul de eliberare. 6. Citopatologie.

Proprietăți antigenice. 1. Caracteristici serologice. 2. Epitopi.

Proprietăți biologice. 1. Cerc de gazde, natural și experimental. 2. Patogenitatea, legătura cu bolile. 3. Tropismul tisular, patologia, histopatologia. 4. Modalități de transmitere în natură. 5. Relații vectoriale. 6. Răspândire geografică.

Genul de virusuri este un grup de specii cu caracteristici comune care diferă de cele ale altor genuri. Denumită de sufixul - virus. Acest nivel ierarhic este, de asemenea, stabil. Criteriile de creare a nașterilor diferă în diferite familii: toate caracteristicile genetice, structurale și altele mai mici sunt folosite pentru a crea noi genuri. Baza este o origine filogenetică comună (ca și pentru familii), dar acest lucru nu este un postulat pentru viitor.

MKTV dezvoltă proprietăți specifice pentru specii din taxon. Evident, termenul "specie" ar trebui definit de ceva similar cu termenul "virus" - deși în unele cazuri termenul "virus" este mai bine combinat cu un subspeci, tulpină sau chiar varianta. Dat fiind că "virusul" este definit diferit în familii diferite, specia trebuie determinată și în moduri diferite, în unele cazuri cu accent pe proprietățile genomului, în altele pe proprietăți structurale, fizico-chimice sau serologice. Anumiți viruși sunt definiți ca specii: poliovirus I, virusul bolii Newcastle. Aceste exemple, totuși, nu reflectă dificultatea de a decide dacă virusul trebuie considerat o specie, un subspeci, o tulpină sau o variantă.

Gama de virusuri, în conformitate cu un sistem universal de clasificare a virusului este determinată de următoarele reguli: 1) la sfârșitul numelui internațional al speciilor de virus ar trebui să fie «... virus», un fel - «... virus», subfamilia - «... virinae», familia - «... viridae», comanda - "... virales"; 2) ordinea, familia, subfamilia, sexul și speciile trebuie imprimate cu caractere cursive (sau subliniate) cu majuscule; 3) numele speciei virusului trebuie precedat de numele ordinii, familiei, subfamiliei și genului; 4) numele de virusi nu sunt reduse.

Exemple de nume de specii:

1. Ordinul lui Mononegavirales. familia Rhabdoviridae. genul Lyssavirus. tip Rhabdovirus.

2. Familia Herpesviridae. subfamilia Alphaherpesvirinae. cursă Simplexvirus. tip - virusul herpes simplex 2.

Clasificarea virusurilor, patogene pentru oameni, este prezentată în Tabelul. 1.

Clasificarea virusurilor care sunt patogene pentru oameni

Articole similare