repararea excizia Nucleotida (ERN, NER) poate fi efectuată în două moduri. În prima hidroliza cazul legăturii fosfodiester la capătul 3 „sau 5“ distanțat de nucleotide nepotrivite (deteriorate), care este apoi îndepărtat în întregime prin acțiunea 5 „-> 3“ (sau 3 „-> 5“) exonuclease, lanț hidrolizarea ADN nucleotidă cu nucleotidă într-o direcție corespunzătoare a originalului diferenței monocatenar în repariruemoy ADN. Decalajul rezultat este apoi umplut cu ADN polimeraza. Acest mecanism de reparare este implementată în E. coli și intacte uman pentru tăiere (nemodificate) nucleotidele nepotrivite. Mecanismul endo- secvențial și clivaj ADN exonuclează nu este utilizat pentru a elimina nucleotide deteriorate (modificate). Acest lucru se datorează, aparent, faptul că astfel de nucleotide (de exemplu, care rezultă din formarea de aducți cu mutageni) adesea sunt inhibitori exonucleaze.
Un al doilea mecanism funcționează în toate organismele speciilor studiate este de a utiliza un sistem enzimatic care introduce lacune monocatenare pe fiecare parte a nucleotidei deteriorate la o anumită distanță de ea, urmată de îndepărtarea fragmentului ADN monocatenar conținând nucleotida modificată.
In mecanismul universal de reparare prin excizie atât procariote și eucariotelor hidrolizată 3-5 th legătură fosfodiester la capătul 3 'terminal al prejudiciului (Fig. I.56). Astfel, procariotele hidrolizat ca legătură 8-lea de la capătul 5 'al nucleotid modificat, în timp ce în organismele eucariote are loc monocatenare decalaj 21-25 de nucleotide în regiunea de la daune de la 5'-end. procariotelor Astfel, nucleotida modificat este îndepărtat compus din oligomeri 12-13-mer, în timp ce eucariotele - constând din fragmente de ADN mono-catenar de 27-29 nucleotide lungime. sistem enzimatic, făcând astfel dublu crestat, numita excizia nucleaza (ekstsinukleazy). Molecula de ADN rezultat repariruemoy gap monocatenar este apoi completat cu ADN polimerază, o legătură fosfodiester în pauza monocatenară rămas este recuperat ADN ligază.
O caracteristică interesantă a EOS a fost, de asemenea, prezența unei împerechere speciale cu transcrierea ramurilor sale, care efectuează reparația în cele mai importante celule ale regiunilor transcrise ale genomului. Într-adevăr, în cazul în care există daune în transcris (șablon) componenta ADN-ului păstrează promovarea polimerazei ARN, speciale TRCF factor proteic (transcripție-reparare factor de cuplare) impinge leagă polimeraza ARN și acest set loc de enzime de reparații. Consultați Conjugarea transcripției și reparației ADN în E / coli. Sunt toate enzimele Sisteme Rețeaua de referință europeană, ca parte a unui singur „reparosomy“ sau Rețeaua de referință europeană - un ansamblu coordonat de enzime de reparații individuale nu este încă clar, cu toate acestea, este, fără îndoială, existența unui complex enzimatic complex, care se numește „ekstsinukleazoy“ și care realizează primele trei din cele patru etape principale ale procesului EOS .
În sistemul de reparare a exciziei ADN-ului prin îndepărtarea nucleotidelor, bazele azotate deteriorate sunt tăiate în compoziția oligonucleotidelor.