singurul și nelegitimul fiu al ducelui Nemours, Giuliano Medici, nepotul lui Lorenzo Magnificul
Tatăl său a murit în 1516, când băiatul avea 5 ani și a fost crescut de unchiul său, pontiful Leo X și vărul Giulio, în viitorul Papă Clement al VII-lea. Leul X a ordonat chiar lui Raphael să scrie un mic Ippolito care se joacă la picioarele lui pe peretele palatului Vaticanului.
După alegerea următorului Papă Giulio, în 1524, în vârstă de 14 de ani, unchiul Ippolito a fost trimis împreună cu vărul său Alessandro în Florența pentru a deveni membru al guvernului, și după ceva timp pentru a gestiona orașul în numele său; Regent a supravegheat asupra lui în timp ce a efectuat cardinalul Silvio Passerini. Trei ani mai târziu, în 1527 revolta republicane fac obiectul unui dumping Passerini și Medici, i-au scos afară din oraș, și Papa, împreună cu împăratul a trebuit să folosească forța pentru a restabili ordinea existentă.
Viața personală
Era fan și, poate, iubita Julia Gonzaga. a doua soție și mama vitregă Vespasiano Colonna Isabella. Înainte de a lua jurămintele religioase, sa presupus că sa căsătorit cu Isabella Colonna, fiica lui Vespasiano Colonna, care a fost menționat în mod specific în voința tatălui viitorului în drept, dar căsătoria nu a avut loc.
După revolta din orașul din 1527, Ippolito sa stabilit temporar la Lucca, unde și-a continuat studiile, anul următor a fost rechemat de papă la Roma. Papa avea de gând să încheie o căsătorie de succes cu nepotul său de 18 ani și a ajuns, practic, la un acord cu Vespasiano Colonna despre mâna fiicei sale Isabella. Ippolito nu a vrut să se căsătorească încă. Unii dintre biografii săi presupun că în acest timp el îl întâlnea deja pe Julia Gonzaga și i-a făcut idealul platonic. El ia dedicat "Traducerea celei de-a doua cărți a Aeneidului în italiană cu un verset alb"
Tatăl fiului ilegal Asdrubale Medici (um.1565), un cavaler maltez al cărui nume mamei este necunoscut (conform legendei, el a fost Julia Gonzaga).
Istoricul Florenței, Scipio Ammirauto, spune că a trăit într-un palat magnific de pe Campo Marzio, unde avea o curte strălucitoare, numărând trei sute de reprezentanți de naționalități diferite. Avea o colecție de animale și de păsări rare care nu au mai fost niciodată văzute în Italia. Printre ei a fost un leu de mână donat lui Francis I și un imens, dat de Caterina Cibo, ducesa lui Camerino. Sansovino raportează că "datorită luxului vieții sale, el merita un nume glorios în toată Italia". A fondat un club pentru studierea lui Vitruvius, care sa întâlnit de două ori pe săptămână la Roma și a fost numit La Virtu.