Orașul a fost fondat în 1255 de către Cavalerii Ordinului Teutonic. De la începutul secolului al XVIII-lea, orașul Koenigsberg era capitala actuală a Prusiei de Est, aici a avut loc încoronarea regilor prusaci.
Conform rezultatelor celui de al doilea război mondial a fost reflectat în deciziile conferințelor Potsdam și Yalta, mai mult de o treime din fosta Prusie de Est, împreună cu orașul Koenigsberg a fost transferat la jurisdicția aliaților din URSS. Majoritatea populației germane au părăsit orașul în 1945, înainte de capturarea Koenigsberg de către trupele sovietice. Aproximativ 20 de mii de locuitori rămași în oraș au fost deportați în Germania între 1945 și 1947.
Koenigsberg a devenit un oraș rus de mai multe ori în istorie. După Războiul de șapte ani între Rusia și Prusia, în 1758, aproape întreg teritoriul de Prusia de Est, și cu ea capitala Koenigsberg, a fost anexată la Imperiul Rus. cetățean rus a devenit chiar celebru filosof german Immanuel Kant, care a trăit în Konigsberg, și a predat la Universitatea din Berlin. Cu toate acestea, în 1762, după aderarea la tron rus de Petru III, atașat de teren au fost returnate în Regatul Prusiei.
În perioada sovietică, Kaliningrad era un oraș închis pentru străini. Monumentele istorice și arhitecturale germane au rămas puțin, iar toate așezările din Prusia de Est, inclusiv zonele urbane și străzile din Kaliningrad, au fost redenumite.
Despre perioada germană din istoria orașului, în moderne Kaliningrad seamănă cu Catedrala (una dintre putinele cladiri ale stilului gotic din Rusia), mausoleul lui Immanuel Kant, Kirch Regina Louise (acum este Teatrul de păpuși), o poarta de caramida câteva - Royal, Brandenburg, Rossgarten, Friedrichsburg, fragmente ale castelului Koenigsberg și alte obiecte arhitecturale.