Ea este foame Nagato și îi dă o bucată de pâine lui. Mai târziu, ea îl conduce la Yahiko, care se plâng că ei trebuie să se hrănească încă câinele. Când Yahiko și Nagato în războiul pierdut părinții lor, ei cauta ajutor de la legendarul Treime. Împreună cu Yahiko și Nagato, Conan devine un student de Jiraiya timp de trei ani. Părinții ei au murit în război, alte rude necunoscute. Jiraiya singurul care îi ajută, iar apoi Conan îi dă o floare de hartie pentru briose. Jiraiya decide să le antreneze. Mai târziu, atunci când acestea sunt în măsură să elimine clona Jiraiya, el spune că au crescut și le eliberează. Ei chiar și astăzi îl numesc Sensei, deși sa întors de la el pentru o lungă perioadă de timp. Ea, ca Nagato, devine membru al „grupurile de rebeli“ create de Yahiko. a răpit-o, apoi Yahiko a fost de acord să semneze un tratat de pace cu Hanzo. Când Nagato și Yahiko găsit-o, atunci este păstrat ca un ostatic și folosit împotriva Nagato: Hanzo ar ucide-o dacă nu ucide Yahiko. Dedicație ea cere Nagato să nu facă acest lucru, dar suficient de mână Yahiko Nagato cu Kuhn și să le impales singur.
Înainte de atacul asupra Konoha Conan Payne a fost cu el în Amegakure. Ea a găsit Jiraiya care a infiltrat în sat. In timp ce Nagato pregătit corpul său pentru luptă, Conan a fost Jiraiya pentru a opri și, dacă este posibil, să-l omoare. Dar împotriva fostului său maestru Conan nu a existat nici o șansă. Sannin ar putea turna hârtie de ulei, după care a devenit inutilizabil, și Conan neajutorat. Dar Chikushodō a sosit la timp, care ar vstuppit în luptă.
În timpul atacului asupra Konoha Conan ia o bancheta din spate, sarcinile de bază în timp ce corpul Nagato. Ea este, de asemenea, încercarea de a afla unde este Naruto, hârtie ninja care acoperă un nivel scăzut și cerându-le, până când nu întrerupe clanul Aburame. După o confruntare mică, dispare. Atunci când toate cele șase moduri Payne a adus înainte de sosirea Naruto, este într-un copac înalt cu hârtie Nagato în afara Konoha. Între timp Nagato condus atacul pe Naruto, ea îl îndeamnă să nu exagerați. Cu toate acestea, el a decis să captureze Naruto la toate costurile. Mai târziu, atunci când toate cele șase corpuri Naruto câștigă, el se revelează toate secretele din spatele lor și sunt capabili de a găsi locația Nagato. El a fost prea slab, care ar rezista Naruto. Conan va veni între Nagato și atac Naruto, dar el poate suprima furia lui și ascultă cuvintele lui Nagato. În timpul apelului, Naruto reușește să convingă Nagato este că există o altă cale spre pace. Nagato începe să creadă pe deplin că Naruto este cel care va aduce pacea în lume și să corecteze greșelile lor. Când Nagato folosește tehnica sa finală, Gedo Rinne Tensei nu Jutsu, ea avertizează Nagato, amintind cantitate mica sa de chakra. Dar e prea târziu. Nagato folosește energia vitală, care ar revigora locuitorii din Konoha, el a ucis în atacul asupra Konoha. După moartea lui Nagato, ea spune Naruto, care crede, de asemenea, în ea. La despărțire, ea dă Naruto un buchet de flori de hârtie. Ea speră că acesta este „culoarea speranței.“ Sper că nu va muri niciodată. Apoi, ea preia corpul Nagato și Yahiko la un sat în ploaie, pe care ea a condus de atunci. Nu are un motiv pentru a rămâne în Akatsuki, ea părăsește organizația.
Mai târziu, Amegakure apare Madara și Konan întâlnit. Madara este de gând să ia o Rinnegan Nagato. Conan refuză să-i dea un corp Nagato și spune că vrea să ucidă Madary. apoi Madara îi spune că el nu cruța. Începe o nouă luptă. Din moment ce Conan privit Madara și de a afla toate punctele slabe ale tehnicii sale a aflat că poate fi în formă non-corporală numai 5 minute. Așa că la atras într-un lac plin de sigilii explozive și organizate 10 minute de explozii fără sfârșit, toate cheltuielile chakra lui. În ciuda faptului că atacul a lovit Madara, el a supraviețuit folosind Izanagi și străpunge Conan decât ca un pol de bambus ascuțit, spunând că el a fost întruchiparea întunericului, din care speră că se va usca. Când se termină Izanagi iluzie, Konan si Madara moare, cu Sharinganul, verificați locația de locație Nagato.
inel Conan, degetul mijlociu de la mana dreapta.